「強化奥義」とは、ボッケモンの持つ奥義を、「イッダマ」を使用することで強化したものだ。「普段よりも威力が高い」「より多くの攻撃を放つ」「軌道が変わる」等、通常の奥義より強力だ。強化に必要なイッダマの数は技によって2種類あり、1つで済むものもあれば、2つ消費するものもある。「強化奥義」は今作から登場した攻めの要となる技だ。思う存分使っていこう。
「強化奥義」を出すにはコマンド入力の最後に押す攻撃ボタンを「弱」「強」の両方同時押しに変えることで出すことができる。

カンタンコマンドなら「技ボタン」を押しながら、「ガードボタン」「弱攻撃ボタン」「強攻撃ボタン」「ライン移動ボタン」のいずれかで出すことができる。技ボタンの代わりに「バックステップボタン」を押しながら同じことをすると、あえて強化せずに通常の奥義を使うことができる。イッダマを温存したいときはこれだ。